雖然益母草在對(duì)付很多女性問題上的效果都很贊，但是對(duì)于益母草的副作用也是要引起很大關(guān)注的，因?yàn)橐婺覆蓦m然有很多作用，但是它在某些方面還是存在弊端的，像是益母草含有微毒性，在動(dòng)物身上實(shí)驗(yàn)有過致動(dòng)物死亡的結(jié)果。而在益母草雖然在產(chǎn)后對(duì)縮宮效果很好，但是益母草卻有著會(huì)讓孕婦流產(chǎn)的潛在危機(jī)，傳有實(shí)驗(yàn)者拿家兔做實(shí)驗(yàn)，而益母草確實(shí)是會(huì)造成家兔流產(chǎn)，所以不建議孕婦食用益母草。

據(jù)悉益母草還會(huì)導(dǎo)致過敏反應(yīng)，傳患者會(huì)表現(xiàn)為胸悶心慌、皮膚發(fā)紅、呼吸加快。過量服用益母草膏后能出現(xiàn)腹瀉腹痛等癥狀，傳益母草具有腎毒性。動(dòng)物實(shí)驗(yàn)表明，益母草可引起大鼠腎間質(zhì)輕度炎癥及少量纖維組織增生、腎小管輕度脂肪變，而在臨床上也有人因食用益母草而導(dǎo)致急性腎功能衰竭的報(bào)道。

雖然益母草可以針對(duì)治療女性身上的很多婦科方面的疾病，但是在小老鼠身上試驗(yàn)，卻意外的發(fā)現(xiàn)益母草居然能促進(jìn)乳腺癌的增長(zhǎng)，而因?yàn)闆]有確切的資料可以證實(shí)，所以益母草和乳腺癌之間的關(guān)系也很曖昧。