先天畸形的治療方法從大方向來說主要有兩種，一種是在孕期就對子宮里的寶寶進行治療，另一種是出生之后再進行的治療。

1.宮內(nèi)治療

胎兒鏡手術(shù)主要應(yīng)用于治療雙胎輸血綜合征或減胎術(shù)，用于治療胎兒膈疝、腦脊膜膨出、泌尿道梗阻等。

2.產(chǎn)后治療

如腦積水的腦室分流手術(shù)、唇腭裂的修補術(shù)、先天性心臟病的手術(shù)治療、苯丙酮尿癥的藥物治療等。

其實多數(shù)非致死性畸形不需要在孕期進行外科干預(yù)，如先天性心臟病等，可在出生后進行手術(shù)治療，但部分先天畸形可能影響胎兒的宮內(nèi)安危，需要在孕期進行干預(yù)，由于手術(shù)風(fēng)險大、技術(shù)要求高，目前多數(shù)胎兒宮內(nèi)治療尚處于試驗性階段。